新疆大学档案馆（校史馆）于2018年10月在原校长办公室档案室的基础上升格成立，下设综合业务科、管理查询科、校史馆、校史研究科4个科室。现有干部职工20人，其中博士学历1人、硕士学历8人，副高职称2人。

档案馆（校史馆）党支部成立于2018年11月，现有党员13名。党支部充分发挥“战斗堡垒”作用，以政治建设为统领，积极开展“党旗映天山”、校史育人、争先创优活动，认真履行“为党管档、为国守史、为民服务”使命，牢牢守住意识形态阵地，传承和发扬“抗大第二”红色基因，服务学校“双一流”建设，为党育人，为国育才。

档案馆馆藏档案10万余卷，每年新增党群、行政、教学、科研、学籍、基建、外事、财会、出版、声像等档案6800余卷。通过现场办理、外送、电话、邮件等形式提供档案查询服务逐年递增，2024年档案查询利用近7000人次，比2023年增长20%以上；聚焦数字赋能，2016年以来，大力推进馆藏及新增档案数字化，目前馆藏档案数字化率达70%，数字档案馆（二期）建设项目正在建设之中。

校史馆始建于1985年，2014年90周年校庆前搬入具有历史和文物价值的“解放楼”，面貌焕然一新。2022年7月12日，习近平总书记视察新疆大学第一站就是参观校史馆，强调育人的根本在立德，要充分发挥红色文化育人作用。2024年“建校百年”校史馆展陈升级改造工作全面完成，展陈内容更加全面、系统、丰富，逻辑更加清晰，主题更加突出。目前新疆大学校史馆已成为自治区爱国主义教育基地、自治区干部培训现场教学基地，入选“第二批自治区特色博物馆”“乌鲁木齐市特色博物馆”，第八批“新疆维吾尔自治区社会科学普及基地”，2024年获批“新疆维吾尔自治区第一批红色法治文化教育基地”。2024年度接待校内外参观人员24000余人，校外参观单位400余家、团体讲解次数达到800余场次。

新疆大学档案馆（校史馆）将继续坚持和加强党的领导，加强政治和思想建设，围绕学校中心工作和重点任务，立德树人，服务师生，锐意进取，创先争优，以奋进之姿奔赴新征程，为实现新疆大学“双一流”建设目标、为学校高质量发展做出新贡献！